Nước hay nước thải sau xử lý sơ bộ, đưa đến bồn lọc áp lực để xử lý vi khuẩn. Các chất rắn tan và không tan đều được giữ lại khi nước đi qua lớp vật liệu lọc, nước trở nên sạch hơn sau khi qua hệ thống, tùy theo nước cũng như chủng loại vật liệu lọc mà khả năng xử lý đối với từng loại vật liệu lọc khác nhau. Sau mỗi chu kỳ lọc, cặn dính bám trên bề mặt lớp vật liệu trên cùng và chúng được lấy ra bằng phương pháp rửa ngược, cặn bẩn sẽ được xới tung lên và các hạt vật liệu lọc va chạm, ma sát vào nhau sẽ tự làm sạch bề mặt của chúng, nước nhiễm bẩn được tháo ra khỏi bồn bằng đường thải riêng biệt.