Phụ phế phẩm nông nghiệp, vỏ cà phê, than bùn, phân gà, heo bò hay bùn thải sau khi xử lý sau khi vận chuyển về khu vực xử lý, xếp thành từng lớp dày khoảng 20 – 30 cm (tưới nước để đảm bảo ẩm độ đạt 50-60%), rải tiếp 1 lớp phân, tưới chế phẩm vi sinh, urê pha loãng 1% lên khối ủ. Tiếp tục xếp phụ phế phẩm nông nghiệp, vỏ cà phê/than bùn và phân gà/bùn thải sau xử lý là thành từng lớp cho đến khi khối ủ cao khoảng 1,2 – 1,5 m. Cuối cùng phủ kín bằng 1 lớp bạt. Định kỳ 7 ngày – 10 ngày, mở bạt ra đảo trộn đều và tưới nước duy trì độ ẩm nước 50 – 60%. Quá trình ủ kéo dài 30 – 45 ngày. Nếu khối ủ khô thì bổ sung thêm nước để độ ẩm đạt 50 – 60%. Nếu khối ủ ướt thì giảm nước để độ ẩm đạt 50 – 60%. Thường xuyên theo dõi độ ẩm của khối ủ, đảo khối ủ khoảng 7 – 10 ngày/lần.